Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SRGAP2BP0DMP2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRGAP2BP0DMP2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms