Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM17P0DL12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM17P0DL12 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM17P0DL12 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM17P0DL12 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM17P0DL12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM17P0DL12 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM17P0DL12 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM17P0DL12 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM17P0DL12 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM17P0DL12 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms