Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49P0CI25 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM49P0CI25 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms