Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC175P0C221 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC175P0C221 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms