Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL3P08700 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL3P08700 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL3P08700 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL3P08700 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL3P08700 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL3P08700 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IL3P08700 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL3P08700 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL3P08700 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL3P08700 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL3P08700 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL3P08700 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL3P08700 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL3P08700 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL3P08700 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL3P08700 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL3P08700 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL3P08700 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IL3P08700 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL3P08700 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL3P08700 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL3P08700 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL3P08700 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3P08700 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL3P08700 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL3P08700 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IL3P08700 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL3P08700 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL3P08700 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IL3P08700 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL3P08700 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL3P08700 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL3P08700 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL3P08700 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IL3P08700 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL3P08700 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL3P08700 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL3P08700 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL3P08700 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL3P08700 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL3P08700 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL3P08700 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL3P08700 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL3P08700 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL3P08700 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL3P08700 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL3P08700 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL3P08700 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL3P08700 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL3P08700 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL3P08700 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL3P08700 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL3P08700 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL3P08700 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL3P08700 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3P08700 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3P08700 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3P08700 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3P08700 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3P08700 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3P08700 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3P08700 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3P08700 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3P08700 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL3P08700 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL3P08700 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL3P08700 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL3P08700 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL3P08700 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL3P08700 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL3P08700 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL3P08700 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL3P08700 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL3P08700 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL3P08700 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL3P08700 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL3P08700 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL3P08700 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL3P08700 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL3P08700 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3P08700 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3P08700 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3P08700 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3P08700 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3P08700 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3P08700 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3P08700 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3P08700 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms