Protein–RNA interactions for Protein: P07305

H1F0, Histone H1.0, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1F0P07305 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H1F0P07305 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H1F0P07305 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H1F0P07305 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H1F0P07305 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H1F0P07305 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H1F0P07305 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H1F0P07305 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H1F0P07305 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H1F0P07305 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H1F0P07305 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H1F0P07305 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H1F0P07305 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H1F0P07305 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H1F0P07305 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H1F0P07305 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H1F0P07305 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H1F0P07305 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H1F0P07305 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H1F0P07305 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H1F0P07305 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H1F0P07305 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H1F0P07305 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H1F0P07305 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H1F0P07305 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H1F0P07305 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H1F0P07305 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
H1F0P07305 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H1F0P07305 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H1F0P07305 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H1F0P07305 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H1F0P07305 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H1F0P07305 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H1F0P07305 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H1F0P07305 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H1F0P07305 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H1F0P07305 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H1F0P07305 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H1F0P07305 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H1F0P07305 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H1F0P07305 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H1F0P07305 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H1F0P07305 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H1F0P07305 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H1F0P07305 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H1F0P07305 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H1F0P07305 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H1F0P07305 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H1F0P07305 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H1F0P07305 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H1F0P07305 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H1F0P07305 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H1F0P07305 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
H1F0P07305 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H1F0P07305 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H1F0P07305 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H1F0P07305 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H1F0P07305 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H1F0P07305 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H1F0P07305 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H1F0P07305 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H1F0P07305 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H1F0P07305 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H1F0P07305 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H1F0P07305 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H1F0P07305 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H1F0P07305 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H1F0P07305 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H1F0P07305 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H1F0P07305 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H1F0P07305 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H1F0P07305 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H1F0P07305 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H1F0P07305 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H1F0P07305 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms