Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CENPBP07199 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CENPBP07199 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CENPBP07199 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CENPBP07199 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CENPBP07199 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CENPBP07199 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CENPBP07199 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CENPBP07199 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CENPBP07199 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CENPBP07199 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CENPBP07199 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CENPBP07199 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CENPBP07199 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CENPBP07199 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CENPBP07199 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CENPBP07199 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CENPBP07199 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CENPBP07199 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CENPBP07199 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CENPBP07199 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CENPBP07199 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CENPBP07199 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CENPBP07199 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CENPBP07199 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CENPBP07199 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CENPBP07199 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CENPBP07199 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CENPBP07199 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CENPBP07199 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CENPBP07199 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CENPBP07199 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CENPBP07199 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CENPBP07199 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CENPBP07199 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CENPBP07199 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CENPBP07199 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
CENPBP07199 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CENPBP07199 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CENPBP07199 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CENPBP07199 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CENPBP07199 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CENPBP07199 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CENPBP07199 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CENPBP07199 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CENPBP07199 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CENPBP07199 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CENPBP07199 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CENPBP07199 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CENPBP07199 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CENPBP07199 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CENPBP07199 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CENPBP07199 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CENPBP07199 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CENPBP07199 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CENPBP07199 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CENPBP07199 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CENPBP07199 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CENPBP07199 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CENPBP07199 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CENPBP07199 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CENPBP07199 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CENPBP07199 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPBP07199 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CENPBP07199 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CENPBP07199 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CENPBP07199 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CENPBP07199 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CENPBP07199 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CENPBP07199 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CENPBP07199 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CENPBP07199 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CENPBP07199 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CENPBP07199 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CENPBP07199 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CENPBP07199 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CENPBP07199 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CENPBP07199 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CENPBP07199 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CENPBP07199 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CENPBP07199 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CENPBP07199 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CENPBP07199 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CENPBP07199 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CENPBP07199 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CENPBP07199 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CENPBP07199 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CENPBP07199 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CENPBP07199 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CENPBP07199 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms