Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DQB2P05538 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DQB2P05538 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DQB2P05538 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DQB2P05538 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DQB2P05538 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DQB2P05538 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DQB2P05538 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DQB2P05538 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms