Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT6BP04259 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT6BP04259 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT6BP04259 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT6BP04259 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT6BP04259 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT6BP04259 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms