Protein–RNA interactions for Protein: P04155

TFF1, Trefoil factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF1P04155 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF1P04155 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF1P04155 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF1P04155 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF1P04155 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF1P04155 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF1P04155 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF1P04155 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF1P04155 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF1P04155 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF1P04155 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF1P04155 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF1P04155 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF1P04155 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF1P04155 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF1P04155 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF1P04155 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF1P04155 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF1P04155 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF1P04155 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF1P04155 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF1P04155 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF1P04155 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF1P04155 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF1P04155 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF1P04155 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF1P04155 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF1P04155 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF1P04155 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF1P04155 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF1P04155 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF1P04155 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF1P04155 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF1P04155 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF1P04155 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF1P04155 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF1P04155 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF1P04155 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF1P04155 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF1P04155 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF1P04155 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF1P04155 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF1P04155 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF1P04155 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF1P04155 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF1P04155 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF1P04155 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF1P04155 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF1P04155 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF1P04155 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF1P04155 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF1P04155 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF1P04155 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF1P04155 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF1P04155 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF1P04155 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF1P04155 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF1P04155 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF1P04155 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF1P04155 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF1P04155 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF1P04155 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF1P04155 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF1P04155 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF1P04155 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF1P04155 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF1P04155 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF1P04155 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF1P04155 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF1P04155 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF1P04155 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF1P04155 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF1P04155 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF1P04155 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF1P04155 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF1P04155 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF1P04155 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF1P04155 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF1P04155 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF1P04155 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF1P04155 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF1P04155 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF1P04155 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF1P04155 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF1P04155 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF1P04155 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF1P04155 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF1P04155 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF1P04155 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF1P04155 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF1P04155 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF1P04155 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF1P04155 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF1P04155 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF1P04155 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF1P04155 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF1P04155 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFF1P04155 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFF1P04155 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFF1P04155 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms