Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP1P03956 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP1P03956 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP1P03956 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP1P03956 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP1P03956 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP1P03956 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP1P03956 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP1P03956 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP1P03956 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MMP1P03956 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MMP1P03956 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MMP1P03956 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP1P03956 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP1P03956 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP1P03956 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP1P03956 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP1P03956 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP1P03956 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP1P03956 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP1P03956 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP1P03956 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP1P03956 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP1P03956 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP1P03956 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP1P03956 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP1P03956 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP1P03956 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP1P03956 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP1P03956 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP1P03956 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP1P03956 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP1P03956 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP1P03956 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP1P03956 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP1P03956 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP1P03956 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP1P03956 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP1P03956 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP1P03956 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP1P03956 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP1P03956 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP1P03956 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP1P03956 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP1P03956 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP1P03956 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP1P03956 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP1P03956 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP1P03956 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP1P03956 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP1P03956 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP1P03956 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP1P03956 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP1P03956 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP1P03956 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP1P03956 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP1P03956 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP1P03956 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP1P03956 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP1P03956 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP1P03956 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP1P03956 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP1P03956 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP1P03956 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP1P03956 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP1P03956 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP1P03956 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP1P03956 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
MMP1P03956 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP1P03956 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP1P03956 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP1P03956 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP1P03956 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP1P03956 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP1P03956 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP1P03956 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MMP1P03956 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP1P03956 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP1P03956 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP1P03956 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP1P03956 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MMP1P03956 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMP1P03956 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMP1P03956 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MMP1P03956 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP1P03956 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP1P03956 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP1P03956 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP1P03956 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP1P03956 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms