Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESR1P03372 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESR1P03372 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESR1P03372 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESR1P03372 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESR1P03372 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESR1P03372 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESR1P03372 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ESR1P03372 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ESR1P03372 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ESR1P03372 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ESR1P03372 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESR1P03372 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESR1P03372 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESR1P03372 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESR1P03372 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESR1P03372 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESR1P03372 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESR1P03372 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESR1P03372 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESR1P03372 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESR1P03372 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ESR1P03372 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ESR1P03372 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ESR1P03372 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ESR1P03372 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ESR1P03372 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ESR1P03372 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESR1P03372 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESR1P03372 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ESR1P03372 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESR1P03372 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESR1P03372 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESR1P03372 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESR1P03372 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ESR1P03372 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ESR1P03372 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ESR1P03372 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ESR1P03372 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESR1P03372 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESR1P03372 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESR1P03372 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESR1P03372 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESR1P03372 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESR1P03372 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESR1P03372 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ESR1P03372 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ESR1P03372 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESR1P03372 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESR1P03372 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESR1P03372 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESR1P03372 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESR1P03372 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESR1P03372 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESR1P03372 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESR1P03372 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ESR1P03372 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESR1P03372 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESR1P03372 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESR1P03372 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESR1P03372 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ESR1P03372 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ESR1P03372 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ESR1P03372 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ESR1P03372 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ESR1P03372 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ESR1P03372 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ESR1P03372 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ESR1P03372 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ESR1P03372 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ESR1P03372 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ESR1P03372 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ESR1P03372 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ESR1P03372 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ESR1P03372 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ESR1P03372 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ESR1P03372 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ESR1P03372 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ESR1P03372 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ESR1P03372 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ESR1P03372 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ESR1P03372 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESR1P03372 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESR1P03372 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESR1P03372 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESR1P03372 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESR1P03372 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESR1P03372 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESR1P03372 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESR1P03372 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms