Protein–RNA interactions for Protein: P02747

C1QC, Complement C1q subcomponent subunit C, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QCP02747 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QCP02747 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QCP02747 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QCP02747 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QCP02747 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QCP02747 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QCP02747 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QCP02747 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QCP02747 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QCP02747 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QCP02747 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QCP02747 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QCP02747 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QCP02747 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QCP02747 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QCP02747 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QCP02747 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QCP02747 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QCP02747 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QCP02747 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QCP02747 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QCP02747 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QCP02747 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QCP02747 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QCP02747 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QCP02747 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QCP02747 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QCP02747 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QCP02747 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QCP02747 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QCP02747 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QCP02747 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1QCP02747 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1QCP02747 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QCP02747 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QCP02747 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QCP02747 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QCP02747 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QCP02747 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QCP02747 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QCP02747 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QCP02747 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QCP02747 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QCP02747 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QCP02747 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QCP02747 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QCP02747 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QCP02747 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QCP02747 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QCP02747 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QCP02747 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QCP02747 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QCP02747 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QCP02747 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QCP02747 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QCP02747 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QCP02747 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QCP02747 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QCP02747 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QCP02747 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QCP02747 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QCP02747 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C1QCP02747 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QCP02747 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QCP02747 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QCP02747 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QCP02747 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QCP02747 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QCP02747 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QCP02747 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QCP02747 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QCP02747 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QCP02747 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QCP02747 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QCP02747 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QCP02747 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QCP02747 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QCP02747 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QCP02747 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QCP02747 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QCP02747 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QCP02747 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QCP02747 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QCP02747 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QCP02747 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QCP02747 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QCP02747 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QCP02747 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QCP02747 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms