Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA1P02647 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA1P02647 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA1P02647 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA1P02647 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA1P02647 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOA1P02647 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA1P02647 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA1P02647 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA1P02647 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA1P02647 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA1P02647 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA1P02647 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA1P02647 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA1P02647 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA1P02647 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA1P02647 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA1P02647 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA1P02647 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA1P02647 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA1P02647 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA1P02647 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA1P02647 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA1P02647 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA1P02647 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA1P02647 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA1P02647 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA1P02647 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA1P02647 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA1P02647 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA1P02647 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA1P02647 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA1P02647 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA1P02647 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA1P02647 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA1P02647 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA1P02647 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA1P02647 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA1P02647 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA1P02647 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA1P02647 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA1P02647 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA1P02647 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA1P02647 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA1P02647 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA1P02647 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA1P02647 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA1P02647 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA1P02647 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA1P02647 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA1P02647 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA1P02647 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA1P02647 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA1P02647 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA1P02647 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA1P02647 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA1P02647 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA1P02647 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA1P02647 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA1P02647 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA1P02647 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA1P02647 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA1P02647 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA1P02647 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA1P02647 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA1P02647 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA1P02647 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA1P02647 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA1P02647 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA1P02647 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA1P02647 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA1P02647 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA1P02647 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA1P02647 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA1P02647 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms