Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL2A1P02458 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL2A1P02458 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL2A1P02458 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms