Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCAP01258 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCAP01258 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCAP01258 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCAP01258 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCAP01258 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCAP01258 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCAP01258 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCAP01258 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCAP01258 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCAP01258 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCAP01258 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCAP01258 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCAP01258 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCAP01258 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCAP01258 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCAP01258 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCAP01258 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCAP01258 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCAP01258 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCAP01258 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCAP01258 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCAP01258 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCAP01258 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCAP01258 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCAP01258 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCAP01258 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCAP01258 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCAP01258 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALCAP01258 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALCAP01258 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALCAP01258 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALCAP01258 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALCAP01258 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALCAP01258 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCAP01258 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCAP01258 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCAP01258 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCAP01258 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCAP01258 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCAP01258 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCAP01258 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALCAP01258 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALCAP01258 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCAP01258 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCAP01258 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCAP01258 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCAP01258 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCAP01258 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCAP01258 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCAP01258 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCAP01258 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCAP01258 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCAP01258 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCAP01258 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCAP01258 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCAP01258 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCAP01258 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCAP01258 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCAP01258 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCAP01258 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCAP01258 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCAP01258 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCAP01258 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCAP01258 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCAP01258 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCAP01258 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCAP01258 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCAP01258 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCAP01258 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCAP01258 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCAP01258 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCAP01258 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCAP01258 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCAP01258 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCAP01258 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCAP01258 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCAP01258 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCAP01258 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCAP01258 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCAP01258 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCAP01258 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCAP01258 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCAP01258 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCAP01258 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCAP01258 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCAP01258 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCAP01258 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCAP01258 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCAP01258 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCAP01258 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCAP01258 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCAP01258 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCAP01258 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCAP01258 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCAP01258 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCAP01258 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCAP01258 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCAP01258 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCAP01258 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms