Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CST1P01037 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST1P01037 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST1P01037 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST1P01037 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST1P01037 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST1P01037 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST1P01037 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CST1P01037 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CST1P01037 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CST1P01037 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CST1P01037 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CST1P01037 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CST1P01037 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CST1P01037 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CST1P01037 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CST1P01037 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CST1P01037 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CST1P01037 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CST1P01037 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CST1P01037 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CST1P01037 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CST1P01037 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST1P01037 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST1P01037 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST1P01037 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST1P01037 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST1P01037 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST1P01037 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CST1P01037 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST1P01037 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST1P01037 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST1P01037 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CST1P01037 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CST1P01037 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CST1P01037 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CST1P01037 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST1P01037 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST1P01037 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST1P01037 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST1P01037 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST1P01037 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST1P01037 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST1P01037 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST1P01037 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST1P01037 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CST1P01037 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CST1P01037 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CST1P01037 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CST1P01037 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CST1P01037 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CST1P01037 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CST1P01037 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST1P01037 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CST1P01037 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CST1P01037 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CST1P01037 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CST1P01037 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CST1P01037 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CST1P01037 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST1P01037 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST1P01037 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST1P01037 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST1P01037 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST1P01037 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST1P01037 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST1P01037 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST1P01037 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST1P01037 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST1P01037 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST1P01037 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CST1P01037 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST1P01037 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST1P01037 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST1P01037 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST1P01037 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST1P01037 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST1P01037 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms