Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPRP00739 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPRP00739 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPRP00739 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPRP00739 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPRP00739 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPRP00739 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPRP00739 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPRP00739 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPRP00739 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPRP00739 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPRP00739 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPRP00739 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPRP00739 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPRP00739 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPRP00739 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPRP00739 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPRP00739 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPRP00739 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPRP00739 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPRP00739 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPRP00739 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPRP00739 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPRP00739 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HPRP00739 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HPRP00739 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPRP00739 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPRP00739 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPRP00739 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPRP00739 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPRP00739 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPRP00739 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPRP00739 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HPRP00739 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPRP00739 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPRP00739 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPRP00739 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HPRP00739 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPRP00739 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPRP00739 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPRP00739 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPRP00739 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HPRP00739 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPRP00739 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPRP00739 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPRP00739 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPRP00739 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPRP00739 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPRP00739 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPRP00739 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPRP00739 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPRP00739 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPRP00739 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPRP00739 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPRP00739 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPRP00739 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPRP00739 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPRP00739 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPRP00739 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPRP00739 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPRP00739 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPRP00739 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPRP00739 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPRP00739 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HPRP00739 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPRP00739 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPRP00739 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPRP00739 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPRP00739 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HPRP00739 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPRP00739 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HPRP00739 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPRP00739 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPRP00739 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPRP00739 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPRP00739 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms