Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX11BO96011 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX11BO96011 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms