Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

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Length 4,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2O95714 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2O95714 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2O95714 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2O95714 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2O95714 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2O95714 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2O95714 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC2O95714 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC2O95714 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC2O95714 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC2O95714 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC2O95714 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC2O95714 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC2O95714 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC2O95714 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC2O95714 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC2O95714 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC2O95714 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC2O95714 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC2O95714 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC2O95714 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC2O95714 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC2O95714 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC2O95714 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC2O95714 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC2O95714 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC2O95714 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC2O95714 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC2O95714 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC2O95714 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC2O95714 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC2O95714 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC2O95714 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC2O95714 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC2O95714 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC2O95714 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC2O95714 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC2O95714 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC2O95714 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC2O95714 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC2O95714 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC2O95714 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC2O95714 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC2O95714 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC2O95714 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC2O95714 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC2O95714 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC2O95714 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC2O95714 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC2O95714 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC2O95714 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC2O95714 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC2O95714 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC2O95714 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC2O95714 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC2O95714 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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