Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
POLR1AO95602 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
POLR1AO95602 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
POLR1AO95602 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms