Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF12O95522 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF12O95522 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms