Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX6O95475 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX6O95475 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX6O95475 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX6O95475 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX6O95475 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX6O95475 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX6O95475 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX6O95475 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX6O95475 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX6O95475 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX6O95475 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX6O95475 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX6O95475 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX6O95475 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX6O95475 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX6O95475 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX6O95475 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX6O95475 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX6O95475 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX6O95475 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX6O95475 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX6O95475 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX6O95475 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX6O95475 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIX6O95475 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX6O95475 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX6O95475 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX6O95475 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX6O95475 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX6O95475 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX6O95475 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX6O95475 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX6O95475 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX6O95475 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX6O95475 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX6O95475 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX6O95475 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX6O95475 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX6O95475 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX6O95475 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX6O95475 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX6O95475 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX6O95475 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX6O95475 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX6O95475 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX6O95475 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX6O95475 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX6O95475 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX6O95475 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX6O95475 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX6O95475 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX6O95475 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX6O95475 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX6O95475 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX6O95475 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX6O95475 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX6O95475 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX6O95475 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX6O95475 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX6O95475 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX6O95475 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX6O95475 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX6O95475 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX6O95475 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX6O95475 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX6O95475 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX6O95475 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX6O95475 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX6O95475 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX6O95475 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX6O95475 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX6O95475 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms