Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGDSO95455 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGDSO95455 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGDSO95455 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGDSO95455 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TGDSO95455 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TGDSO95455 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGDSO95455 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGDSO95455 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TGDSO95455 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGDSO95455 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGDSO95455 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGDSO95455 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TGDSO95455 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGDSO95455 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGDSO95455 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGDSO95455 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGDSO95455 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGDSO95455 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGDSO95455 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGDSO95455 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGDSO95455 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGDSO95455 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGDSO95455 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGDSO95455 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGDSO95455 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGDSO95455 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGDSO95455 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGDSO95455 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGDSO95455 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGDSO95455 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGDSO95455 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGDSO95455 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGDSO95455 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGDSO95455 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGDSO95455 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGDSO95455 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGDSO95455 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGDSO95455 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGDSO95455 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGDSO95455 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGDSO95455 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGDSO95455 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGDSO95455 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGDSO95455 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TGDSO95455 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGDSO95455 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGDSO95455 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGDSO95455 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGDSO95455 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGDSO95455 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGDSO95455 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGDSO95455 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGDSO95455 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGDSO95455 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGDSO95455 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGDSO95455 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGDSO95455 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGDSO95455 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGDSO95455 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGDSO95455 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGDSO95455 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGDSO95455 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGDSO95455 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGDSO95455 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGDSO95455 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGDSO95455 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TGDSO95455 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGDSO95455 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGDSO95455 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGDSO95455 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGDSO95455 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGDSO95455 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGDSO95455 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGDSO95455 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGDSO95455 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGDSO95455 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGDSO95455 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TGDSO95455 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGDSO95455 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGDSO95455 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGDSO95455 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGDSO95455 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGDSO95455 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGDSO95455 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGDSO95455 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGDSO95455 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGDSO95455 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGDSO95455 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms