Protein–RNA interactions for Protein: O95361

TRIM16, Tripartite motif-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16O95361 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM16O95361 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM16O95361 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM16O95361 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms