Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP72O76094 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP72O76094 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP72O76094 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP72O76094 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP72O76094 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP72O76094 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP72O76094 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP72O76094 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP72O76094 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP72O76094 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRP72O76094 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP72O76094 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP72O76094 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP72O76094 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP72O76094 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP72O76094 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP72O76094 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP72O76094 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP72O76094 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP72O76094 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP72O76094 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP72O76094 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP72O76094 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP72O76094 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP72O76094 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP72O76094 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP72O76094 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP72O76094 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP72O76094 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP72O76094 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP72O76094 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP72O76094 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP72O76094 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP72O76094 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP72O76094 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP72O76094 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP72O76094 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP72O76094 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP72O76094 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP72O76094 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP72O76094 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP72O76094 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP72O76094 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP72O76094 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP72O76094 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP72O76094 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP72O76094 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP72O76094 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP72O76094 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP72O76094 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP72O76094 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP72O76094 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP72O76094 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP72O76094 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP72O76094 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP72O76094 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP72O76094 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP72O76094 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP72O76094 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP72O76094 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP72O76094 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP72O76094 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP72O76094 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP72O76094 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP72O76094 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP72O76094 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP72O76094 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP72O76094 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP72O76094 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP72O76094 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP72O76094 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP72O76094 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP72O76094 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP72O76094 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP72O76094 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP72O76094 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP72O76094 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP72O76094 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP72O76094 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP72O76094 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP72O76094 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP72O76094 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP72O76094 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms