Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRCPO75575 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRCPO75575 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRCPO75575 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRCPO75575 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRCPO75575 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRCPO75575 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRCPO75575 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRCPO75575 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRCPO75575 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRCPO75575 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRCPO75575 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRCPO75575 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRCPO75575 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRCPO75575 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRCPO75575 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRCPO75575 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRCPO75575 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRCPO75575 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRCPO75575 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRCPO75575 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRCPO75575 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRCPO75575 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRCPO75575 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRCPO75575 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRCPO75575 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRCPO75575 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRCPO75575 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRCPO75575 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRCPO75575 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRCPO75575 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRCPO75575 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRCPO75575 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRCPO75575 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRCPO75575 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRCPO75575 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRCPO75575 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRCPO75575 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRCPO75575 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRCPO75575 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRCPO75575 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRCPO75575 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRCPO75575 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRCPO75575 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRCPO75575 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRCPO75575 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRCPO75575 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRCPO75575 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRCPO75575 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRCPO75575 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRCPO75575 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRCPO75575 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRCPO75575 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRCPO75575 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRCPO75575 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRCPO75575 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRCPO75575 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRCPO75575 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRCPO75575 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRCPO75575 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRCPO75575 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRCPO75575 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRCPO75575 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRCPO75575 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRCPO75575 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRCPO75575 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRCPO75575 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRCPO75575 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRCPO75575 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRCPO75575 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRCPO75575 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRCPO75575 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRCPO75575 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRCPO75575 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRCPO75575 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRCPO75575 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRCPO75575 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRCPO75575 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CRCPO75575 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRCPO75575 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRCPO75575 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRCPO75575 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRCPO75575 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRCPO75575 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRCPO75575 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRCPO75575 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRCPO75575 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms