Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC45O75419 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC45O75419 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC45O75419 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC45O75419 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC45O75419 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC45O75419 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC45O75419 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC45O75419 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC45O75419 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC45O75419 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC45O75419 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC45O75419 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC45O75419 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC45O75419 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC45O75419 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC45O75419 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC45O75419 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC45O75419 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC45O75419 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC45O75419 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC45O75419 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC45O75419 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC45O75419 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC45O75419 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC45O75419 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC45O75419 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC45O75419 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC45O75419 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC45O75419 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC45O75419 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC45O75419 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC45O75419 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC45O75419 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDC45O75419 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDC45O75419 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC45O75419 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC45O75419 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC45O75419 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC45O75419 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC45O75419 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC45O75419 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC45O75419 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC45O75419 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC45O75419 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC45O75419 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC45O75419 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC45O75419 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC45O75419 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC45O75419 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC45O75419 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC45O75419 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC45O75419 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC45O75419 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC45O75419 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC45O75419 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC45O75419 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC45O75419 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC45O75419 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC45O75419 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC45O75419 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC45O75419 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC45O75419 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC45O75419 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC45O75419 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC45O75419 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDC45O75419 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC45O75419 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC45O75419 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC45O75419 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC45O75419 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC45O75419 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC45O75419 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC45O75419 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC45O75419 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC45O75419 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC45O75419 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC45O75419 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC45O75419 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms