Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC22BO75396 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22BO75396 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms