Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRLO75368 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRLO75368 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRLO75368 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRLO75368 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRLO75368 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRLO75368 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRLO75368 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRLO75368 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRLO75368 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
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