Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45BO75293 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45BO75293 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45BO75293 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GADD45BO75293 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45BO75293 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GADD45BO75293 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45BO75293 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms