Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAB11FIP3O75154 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB11FIP3O75154 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB11FIP3O75154 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB11FIP3O75154 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms