Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSCO60682 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSCO60682 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSCO60682 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSCO60682 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSCO60682 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSCO60682 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSCO60682 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSCO60682 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSCO60682 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSCO60682 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSCO60682 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MSCO60682 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSCO60682 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MSCO60682 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSCO60682 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSCO60682 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MSCO60682 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSCO60682 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSCO60682 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSCO60682 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MSCO60682 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSCO60682 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSCO60682 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSCO60682 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSCO60682 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSCO60682 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSCO60682 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSCO60682 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSCO60682 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSCO60682 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MSCO60682 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSCO60682 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSCO60682 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSCO60682 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSCO60682 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSCO60682 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MSCO60682 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSCO60682 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSCO60682 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSCO60682 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MSCO60682 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MSCO60682 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MSCO60682 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSCO60682 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSCO60682 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSCO60682 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSCO60682 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSCO60682 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSCO60682 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSCO60682 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSCO60682 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSCO60682 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSCO60682 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSCO60682 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSCO60682 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSCO60682 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSCO60682 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSCO60682 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSCO60682 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSCO60682 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSCO60682 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSCO60682 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MSCO60682 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MSCO60682 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSCO60682 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSCO60682 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSCO60682 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSCO60682 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSCO60682 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSCO60682 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MSCO60682 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSCO60682 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSCO60682 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSCO60682 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSCO60682 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSCO60682 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSCO60682 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSCO60682 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms