Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA3O60609 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA3O60609 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA3O60609 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA3O60609 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA3O60609 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA3O60609 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA3O60609 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GFRA3O60609 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFRA3O60609 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms