Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE6DO43924 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE6DO43924 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE6DO43924 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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PDE6DO43924 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PDE6DO43924 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PDE6DO43924 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PDE6DO43924 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE6DO43924 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PDE6DO43924 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PDE6DO43924 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PDE6DO43924 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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