Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR2O43760 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms