Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRKAB2O43741 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKAB2O43741 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms