Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACTN4O43707 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN4O43707 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.4 ms