Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD51CO43502 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms