Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIAH2O43255 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIAH2O43255 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIAH2O43255 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms