Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLOCKO15516 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLOCKO15516 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms