Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FANCAO15360 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FANCAO15360 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FANCAO15360 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FANCAO15360 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FANCAO15360 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FANCAO15360 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
FANCAO15360 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
FANCAO15360 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
FANCAO15360 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FANCAO15360 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FANCAO15360 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FANCAO15360 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
FANCAO15360 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FANCAO15360 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FANCAO15360 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FANCAO15360 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
FANCAO15360 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
FANCAO15360 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
FANCAO15360 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
FANCAO15360 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
FANCAO15360 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FANCAO15360 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FANCAO15360 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
FANCAO15360 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FANCAO15360 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FANCAO15360 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FANCAO15360 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FANCAO15360 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
FANCAO15360 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
FANCAO15360 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
FANCAO15360 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
FANCAO15360 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
FANCAO15360 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
FANCAO15360 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
FANCAO15360 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FANCAO15360 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FANCAO15360 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
FANCAO15360 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
FANCAO15360 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
FANCAO15360 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
FANCAO15360 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FANCAO15360 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
FANCAO15360 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
FANCAO15360 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
FANCAO15360 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
FANCAO15360 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FANCAO15360 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FANCAO15360 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FANCAO15360 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FANCAO15360 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
FANCAO15360 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
FANCAO15360 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
FANCAO15360 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
FANCAO15360 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
FANCAO15360 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
FANCAO15360 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
FANCAO15360 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
FANCAO15360 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37■■■■□ 3.51
FANCAO15360 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
FANCAO15360 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FANCAO15360 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
FANCAO15360 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
FANCAO15360 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FANCAO15360 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FANCAO15360 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FANCAO15360 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
FANCAO15360 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
FANCAO15360 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
FANCAO15360 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
FANCAO15360 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FANCAO15360 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
FANCAO15360 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FANCAO15360 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FANCAO15360 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FANCAO15360 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FANCAO15360 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FANCAO15360 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FANCAO15360 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
FANCAO15360 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FANCAO15360 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FANCAO15360 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
FANCAO15360 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
FANCAO15360 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FANCAO15360 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FANCAO15360 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FANCAO15360 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FANCAO15360 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FANCAO15360 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FANCAO15360 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FANCAO15360 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FANCAO15360 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
FANCAO15360 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
FANCAO15360 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FANCAO15360 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FANCAO15360 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
FANCAO15360 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FANCAO15360 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FANCAO15360 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FANCAO15360 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms