Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VGFO15240 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VGFO15240 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VGFO15240 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
VGFO15240 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
VGFO15240 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
VGFO15240 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
VGFO15240 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
VGFO15240 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
VGFO15240 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
VGFO15240 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
VGFO15240 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
VGFO15240 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
VGFO15240 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
VGFO15240 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
VGFO15240 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
VGFO15240 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
VGFO15240 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VGFO15240 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VGFO15240 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VGFO15240 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VGFO15240 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VGFO15240 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
VGFO15240 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
VGFO15240 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
VGFO15240 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
VGFO15240 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
VGFO15240 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
VGFO15240 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
VGFO15240 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
VGFO15240 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
VGFO15240 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
VGFO15240 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
VGFO15240 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
VGFO15240 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
VGFO15240 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
VGFO15240 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
VGFO15240 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
VGFO15240 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
VGFO15240 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VGFO15240 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VGFO15240 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
VGFO15240 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
VGFO15240 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
VGFO15240 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VGFO15240 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
VGFO15240 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VGFO15240 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VGFO15240 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
VGFO15240 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
VGFO15240 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
VGFO15240 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VGFO15240 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VGFO15240 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
VGFO15240 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VGFO15240 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VGFO15240 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
VGFO15240 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
VGFO15240 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
VGFO15240 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
VGFO15240 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
VGFO15240 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
VGFO15240 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
VGFO15240 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
VGFO15240 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
VGFO15240 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
VGFO15240 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
VGFO15240 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
VGFO15240 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
VGFO15240 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
VGFO15240 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
VGFO15240 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
VGFO15240 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
VGFO15240 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
VGFO15240 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
VGFO15240 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
VGFO15240 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
VGFO15240 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VGFO15240 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VGFO15240 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
VGFO15240 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VGFO15240 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
VGFO15240 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
VGFO15240 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VGFO15240 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
VGFO15240 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VGFO15240 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
VGFO15240 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VGFO15240 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
VGFO15240 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
VGFO15240 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
VGFO15240 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VGFO15240 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VGFO15240 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VGFO15240 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VGFO15240 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VGFO15240 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VGFO15240 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VGFO15240 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VGFO15240 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms