Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMA5O15230 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA5O15230 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms