Protein–RNA interactions for Protein: O15145

ARPC3, Actin-related protein 2/3 complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC3O15145 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC3O15145 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC3O15145 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC3O15145 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC3O15145 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC3O15145 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARPC3O15145 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC3O15145 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms