Protein–RNA interactions for Protein: O15119

TBX3, T-box transcription factor TBX3, humanhuman

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX3O15119 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBX3O15119 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBX3O15119 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBX3O15119 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBX3O15119 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBX3O15119 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBX3O15119 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TBX3O15119 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TBX3O15119 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TBX3O15119 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TBX3O15119 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TBX3O15119 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TBX3O15119 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TBX3O15119 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TBX3O15119 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TBX3O15119 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TBX3O15119 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TBX3O15119 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TBX3O15119 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TBX3O15119 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TBX3O15119 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TBX3O15119 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TBX3O15119 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TBX3O15119 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TBX3O15119 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TBX3O15119 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TBX3O15119 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TBX3O15119 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TBX3O15119 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TBX3O15119 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TBX3O15119 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TBX3O15119 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TBX3O15119 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TBX3O15119 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TBX3O15119 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TBX3O15119 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TBX3O15119 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TBX3O15119 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TBX3O15119 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TBX3O15119 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TBX3O15119 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TBX3O15119 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TBX3O15119 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TBX3O15119 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TBX3O15119 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TBX3O15119 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TBX3O15119 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TBX3O15119 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TBX3O15119 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TBX3O15119 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TBX3O15119 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TBX3O15119 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TBX3O15119 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TBX3O15119 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TBX3O15119 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TBX3O15119 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TBX3O15119 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TBX3O15119 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TBX3O15119 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TBX3O15119 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBX3O15119 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBX3O15119 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBX3O15119 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBX3O15119 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBX3O15119 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TBX3O15119 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBX3O15119 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBX3O15119 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBX3O15119 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBX3O15119 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBX3O15119 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TBX3O15119 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TBX3O15119 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBX3O15119 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBX3O15119 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBX3O15119 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBX3O15119 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBX3O15119 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBX3O15119 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TBX3O15119 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBX3O15119 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBX3O15119 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBX3O15119 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBX3O15119 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBX3O15119 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBX3O15119 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBX3O15119 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBX3O15119 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBX3O15119 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBX3O15119 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBX3O15119 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBX3O15119 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TBX3O15119 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TBX3O15119 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TBX3O15119 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TBX3O15119 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TBX3O15119 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TBX3O15119 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TBX3O15119 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TBX3O15119 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms