Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHUKO15111 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHUKO15111 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHUKO15111 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHUKO15111 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHUKO15111 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHUKO15111 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHUKO15111 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHUKO15111 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHUKO15111 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHUKO15111 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHUKO15111 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHUKO15111 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHUKO15111 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHUKO15111 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHUKO15111 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHUKO15111 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHUKO15111 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHUKO15111 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHUKO15111 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHUKO15111 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHUKO15111 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHUKO15111 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHUKO15111 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHUKO15111 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHUKO15111 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHUKO15111 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHUKO15111 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHUKO15111 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHUKO15111 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHUKO15111 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHUKO15111 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHUKO15111 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHUKO15111 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHUKO15111 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHUKO15111 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHUKO15111 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHUKO15111 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHUKO15111 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHUKO15111 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHUKO15111 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHUKO15111 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHUKO15111 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHUKO15111 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHUKO15111 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHUKO15111 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHUKO15111 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHUKO15111 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHUKO15111 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHUKO15111 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHUKO15111 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHUKO15111 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHUKO15111 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHUKO15111 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHUKO15111 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHUKO15111 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHUKO15111 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHUKO15111 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHUKO15111 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHUKO15111 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHUKO15111 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHUKO15111 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHUKO15111 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHUKO15111 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHUKO15111 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHUKO15111 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHUKO15111 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHUKO15111 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHUKO15111 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHUKO15111 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHUKO15111 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHUKO15111 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHUKO15111 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHUKO15111 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHUKO15111 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHUKO15111 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHUKO15111 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHUKO15111 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHUKO15111 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHUKO15111 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHUKO15111 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHUKO15111 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHUKO15111 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHUKO15111 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHUKO15111 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHUKO15111 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHUKO15111 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHUKO15111 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHUKO15111 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHUKO15111 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHUKO15111 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHUKO15111 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHUKO15111 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHUKO15111 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHUKO15111 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHUKO15111 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHUKO15111 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHUKO15111 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHUKO15111 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHUKO15111 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms