Protein–RNA interactions for Protein: O15067

PFAS, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFASO15067 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFASO15067 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFASO15067 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFASO15067 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFASO15067 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFASO15067 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFASO15067 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFASO15067 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFASO15067 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFASO15067 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFASO15067 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PFASO15067 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PFASO15067 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PFASO15067 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PFASO15067 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFASO15067 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFASO15067 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PFASO15067 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PFASO15067 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFASO15067 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFASO15067 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFASO15067 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFASO15067 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFASO15067 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFASO15067 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFASO15067 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFASO15067 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFASO15067 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFASO15067 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFASO15067 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFASO15067 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFASO15067 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFASO15067 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFASO15067 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFASO15067 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFASO15067 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFASO15067 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFASO15067 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFASO15067 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFASO15067 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFASO15067 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFASO15067 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFASO15067 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFASO15067 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFASO15067 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFASO15067 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFASO15067 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFASO15067 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFASO15067 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PFASO15067 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFASO15067 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFASO15067 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFASO15067 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFASO15067 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFASO15067 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFASO15067 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFASO15067 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PFASO15067 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFASO15067 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFASO15067 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFASO15067 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFASO15067 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFASO15067 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFASO15067 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFASO15067 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFASO15067 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PFASO15067 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFASO15067 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFASO15067 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFASO15067 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFASO15067 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFASO15067 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PFASO15067 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PFASO15067 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PFASO15067 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PFASO15067 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PFASO15067 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFASO15067 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PFASO15067 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PFASO15067 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PFASO15067 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PFASO15067 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PFASO15067 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFASO15067 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PFASO15067 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PFASO15067 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFASO15067 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFASO15067 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PFASO15067 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PFASO15067 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PFASO15067 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PFASO15067 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PFASO15067 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PFASO15067 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFASO15067 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFASO15067 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFASO15067 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFASO15067 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFASO15067 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFASO15067 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms