Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLGNO14967 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLGNO14967 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLGNO14967 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLGNO14967 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLGNO14967 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLGNO14967 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLGNO14967 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLGNO14967 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLGNO14967 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLGNO14967 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLGNO14967 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLGNO14967 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLGNO14967 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLGNO14967 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLGNO14967 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLGNO14967 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLGNO14967 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLGNO14967 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLGNO14967 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLGNO14967 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLGNO14967 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLGNO14967 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLGNO14967 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLGNO14967 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLGNO14967 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLGNO14967 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLGNO14967 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLGNO14967 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLGNO14967 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLGNO14967 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLGNO14967 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLGNO14967 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLGNO14967 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLGNO14967 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLGNO14967 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLGNO14967 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLGNO14967 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLGNO14967 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLGNO14967 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLGNO14967 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLGNO14967 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLGNO14967 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLGNO14967 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLGNO14967 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLGNO14967 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLGNO14967 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLGNO14967 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLGNO14967 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLGNO14967 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLGNO14967 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLGNO14967 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLGNO14967 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLGNO14967 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLGNO14967 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLGNO14967 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLGNO14967 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLGNO14967 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLGNO14967 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLGNO14967 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLGNO14967 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLGNO14967 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLGNO14967 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLGNO14967 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLGNO14967 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLGNO14967 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLGNO14967 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLGNO14967 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLGNO14967 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms