Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPEO14579 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPEO14579 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPEO14579 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COPEO14579 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPEO14579 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPEO14579 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPEO14579 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPEO14579 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPEO14579 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPEO14579 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPEO14579 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPEO14579 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPEO14579 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPEO14579 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPEO14579 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPEO14579 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPEO14579 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPEO14579 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPEO14579 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPEO14579 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPEO14579 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPEO14579 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPEO14579 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPEO14579 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPEO14579 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPEO14579 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPEO14579 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPEO14579 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPEO14579 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPEO14579 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPEO14579 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPEO14579 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPEO14579 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPEO14579 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPEO14579 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPEO14579 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPEO14579 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPEO14579 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPEO14579 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPEO14579 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPEO14579 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPEO14579 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPEO14579 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPEO14579 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPEO14579 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPEO14579 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPEO14579 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COPEO14579 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPEO14579 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPEO14579 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPEO14579 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPEO14579 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPEO14579 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPEO14579 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COPEO14579 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPEO14579 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPEO14579 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPEO14579 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPEO14579 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPEO14579 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPEO14579 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPEO14579 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPEO14579 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPEO14579 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPEO14579 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPEO14579 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPEO14579 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPEO14579 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPEO14579 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPEO14579 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms